При уплате индивидуальным предпринимателем единого налога на вмененный доход он освобождается от уплаты налога на доходы физических лиц, единого социального налога (в отношении доходов, полученных от деятельности облагаемых единым налогом), налога на имущество физических лиц (в отношении имущества используемого в деятельности, облагаемой единым налогом). Индивидуальные предприниматели не являются плательщиками налога на добавленную стоимость.

С вступлением в силу с 2013 года Федерального закона № 402 «О бухгалтерском учете» изменится и бухгалтерский учет ИП в 2013 году. Согласно этому закону учет должны вести все малые предприятия и ИП. Но от бухучета освобождаются те предприниматели, которые ведут учет в соответствии с Налоговым Кодексом (ст.6 №402-ФЗ). А это значит, что те ИП, которые работают по УСН, могут продолжать вести только учет доходов и расходов согласно Налоговому Кодексу.

С начала 2013 года мототранспорт для целей налогообложения приравняли к автотранспортным средствам. Теперь автостоянка переименована в автомотостоянку, автомойка — в автомотомойку, а авторемонт — в автомотомастерскую. Рекламой на транспорте будет считаться информация, размещенная и внутри салона, а не только та, что снаружи (в том числе на панелях, сидениях, ручках и держателях).

Обязательный перевод на уплату ЕНВД отдельных видов деятельности зачастую оборачивается для компаний дополнительными проблемами. Ведь в случае осуществления на территории одного магазина деятельности, подпадающей и не подпадающей под обложение ЕНВД, налогоплательщику приходится применять два режима налогообложения и вести раздельный учет. При этом уменьшить сумму ЕНВД за счет сокращения площади он не сможет.

В отличие от УСН, ЕНВД является обязательным налоговым режимом: организация или ИП обязаны на него перейти, если органом местного самоуправления принят соответствующий нормативный правовой акт, обязывающий применять ЕНВД для определенных видов деятельности.